(Wilayah Persekutuan) 

Bandiera adottata il 26 maggio 2006, introdotta dal governo malaysiano nel tentativo di creare l'unità e l'identità per i suoi tre Territori Federali di Kuala Lumpur, Putrajaya e Labuan. La bandiera rappresenta tutti e tre i territori, ed è usata come bandiera ufficiale insieme alle singole bandiere territoriali. Il giallo rappresenta il rispetto, la sovranità e l'onore; il rosso la forza, coraggio ed energia; mentre il blu sta per l'unità, la sincerità e l'armonia. Le tre stelle sotto l'emblema nazionale stanno per i tre territori. La bandiera è stata progettata dai consulenti dell'Universiti Teknologi MARA (UiTM).  Proporzioni 1:2.